Das Genom-Sequenzierkonsortium an der Universitätsmedizin Mainz

Das Genom-Sequenzierkonsortium aus Einrichtungen der Universitätsmedizin Mainz, der Johannes Gutenberg-Universität sowie der Firma StarSEQ wurde während der SARS-CoV-2-Pandemie gegründet und initial vom Ministerium für Wissenschaft und Gesundheit Rheinland-Pfalz gefördert. In diesem Zuge wurden von uns über 5000 Vollgenomsequenzierungen des Covid-19-auslösenden Virus durchgeführt. Die meisten hierbei generierten Sequenzen sind in der GISAID-Datenbank öffentlich verfügbar. Mittlerweile haben wir unseren Fokus deutlich erweitert und setzen diverse Projekte im Bereich Genomik an der Schnittstelle von Grundlagenforschung und Krankenversorgung um.

NEWS

06. Juli 2024: Unsere Studie zum Varianten-Monitoring von SARS-CoV-2 in der Klinik ist bei Infection Prevention in Practice publiziert!

July 06, 2024: Our study on variant monitoring of SARS-CoV-2 in the clinic is published at Infection Prevention in Practice!

Link zur Studie

24. Juni 2024: Wir beteiligen uns am Projekt "Einbeziehung molekularer Methoden zur Feincharakterisierung sowie zum direkten Nachweis von Polioviren aus Abwasserproben (PIA II)“ des Nationalen Referenzzentrums für Poliomyelitis und Enteroviren am Robert Koch-Institut!

June 24, 2024: We are participating in the project “Inclusion of molecular methods for fine characterization and direct detection of polioviruses from wastewater samples (PIA II)” of the National Reference Center for Poliomyelitis and Enteroviruses at the Robert Koch Institute!

Link zum Abwassermonitoring des RKI

24. April 2024: Das Paper zur Mpox-Genomsequenzierung mithilfe neuester adaptive sampling-Strategie ist jetzt beim Journal of Medical Virology online!

April 24, 2024: The paper on Mpox genome sequencing using the latest adaptive sampling strategy is now online at the Journal of Medical Virology!

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25. März 2024: Prof. Plachter und Dr. Schmidt präsentieren auf der 33. Jahrestagung der Gesellschaft für Virologie e.V. in Wien die Ergebnisse aus unserem SARS-CoV-2-Abwassermonitoring!

March 25, 2024: Prof. Plachter and Dr. Schmidt present the results of our SARS-CoV-2 wastewater monitoring at the 33rd Annual Meeting of the Society for Virology in Vienna!

07. Dezember 2023: Prof. Plachter und Dr. Schmidt haben ein Kapitel "Virologische Grundlagen und Varianten-Surveillance durch Genomsequenzierung" geschrieben, das nun im Buch Corona und Arbeit erschienen ist.

December 07, 2023: Prof. Plachter and Dr. Schmidt have written a chapter on virological basics and variant surveillance by genome sequencing, which has now been published in the book Corona und Arbeit.

Link zum Buch

13. September 2023: Das Ministerium für Wissenschaft und Gesundheit Rheinland-Pfalz fördert unser Projekt "SARS-CoV-2-Variantenscreening" von Oktober 2023 bis März 2024 mit rund 140.000 €!

September 13, 2023: The Ministry of Science and Health Rhineland-Palatinate is funding our project “SARS-CoV-2 Variant Screening” from October 2023 to March 2024 with about € 140,000!

28. Februar 2023: Daniel Stich, Ministerialdirektor des Ministeriums für Wissenschaft und Gesundheit Rheinland-Pfalz, hat uns heute die unterschriebene Kooperationszusage für ein auf Polio abzielendes Abwassermonitoring-Projekt mit dem Robert Koch-Institut zukommen lassen.

February 28, 2023: Daniel Stich, Ministerial Director of the Ministry of Science and Health Rhineland-Palatinate , today sent us the signed cooperation agreement for a polio-targeted wastewater monitoring project with the Robert Koch Institute.

04. September 2022: Das Ministerium für Wissenschaft und Gesundheit Rheinland-Pfalz fördert unser Projekt "Sequenzierungsbasiertes Corona-Abwassermonitoring" von Oktober 2022 bis März 2023 mit rund 95.000 €!

September 04, 2022: The Ministry of Science and Health Rhineland-Palatinate is funding our project “Sequencing-based corona wastewater monitoring” from October 2022 to March 2023 with about € 95,000!

31. August 2022: Pressemitteilung der Universitätsmedizin Mainz zu unserer Genomsequenzierung an Affenpocken. Erstmals kam die adaptive sampling-Strategie unseres PromethION-Sequenzierers zum Einsatz!

August 31, 2022: Press release of the Mainz University Medical Center on our genome sequencing of monkeypox. The adaptive sampling strategy of our PromethION sequencer was used for the first time!

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25. Juli 2022: Der neue Sequenzierer ist da! Der PromethION24, ein Gerät der dritten Generation, konnte durch die Förderung des Ministeriums für Wissenschaft und Gesundheit Rheinland-Pfalz angeschafft werden und wird die methodischen Möglichkeiten des Genom-Sequenzierkonsortiums zusätzlich erweitern.

July 25, 2022: The new sequencer is here! The PromethION24, a third-generation device, was purchased thanks to funding from the Ministry of Science and Health Rhineland-Palatinate and will further expand the methodological possibilities of the genome sequencing consortium.

15. Dezember 2021: Pressemitteilung der Universitätsmedizin Mainz zum zweiten Omikron-Fall in Rheinland-Pfalz, nachgewiesen von unserem Genom-Sequenzierkonsortium!

December 15, 2021: Press release of the Mainz University Medical Center on the second Omikron case in Rhineland-Palatinate, detected by our genome sequencing consortium!

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04. März 2021: In der Allgemeinen Zeitung ist heute ein Artikel zu der von uns gefundenen "Mainzer Coronavirus-Mutante" erschienen!

March 04, 2021: An article about the “Mainz coronavirus mutant” found by us was published today in the Allgemeine Zeitung!

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12. Februar 2021: Unser Preprint "SARS-CoV-2 genome surveillance in Mainz, Germany, reveals convergent origin of the N501Y spike mutation in a hospital setting" ist jetzt online!

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